Costruita nell’anno 1838 utilizzando materiali provenienti dalla demolita chiesa dell’Annunziata. Infatti la vecchia chiesa dell’Annunziata si trovava al centro dell’attuale piazza de Longobardi venne abbattuta insieme alle case vicine per risanare quel quartiere.
Dall’Annunziata vennero trasportati in quella di San Toma, la campana, le urne cinerarie dei De Cuneo ed un altorilievo ligneo raffigurante l’Annunciazione. Trattasi di un lavoro di scultura di bellissima fattura fatto eseguire per l’altare maggiore della chiesa dell’Annunziata dal conte di Trani Manfredi De Cuneo.